Los institutos dependientes del Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (Conicet), que tienen convenios con la UNT, son dirigidos por docentes e investigadores de distintas Facultades, los que también integran sus planteles.

Cerela es un instituto de investigaciones de nivel superior dedicado al estudio de bacterias lácticas (BAL) en dos grandes áreas: alimentos y salud humana y animal. Fue creado a través de un convenio del que participaron tres organismos: el Conicet, la Fundación Miguel Lillo y la Fundación para la Educación, la Ciencia y la Cultura (FECIC).
El Convenio Marco firmado entre el Conicety la Universidad Nacional de Tucumán (UNT) permitió optimizar el uso de infraestructura y compartir recursos humanos, además de la formación de profesionales especializados en el área de microbiología y biotecnología de bacterias lácticas.

Página web:www.cerela.org.ar/

Proimi pertenece al sistema científico nacional especializado en las áreas de microbiología y de biotecnología. Fue creada en julio de 1978 por un convenio entre Conicet (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas) y Fecic (Fundación para la Educación, la Ciencia y la Cultura). La planta es sede del Mircen - Biotecnología (Microbiological Resources Center) para Sud América.

Página web: www.proimi.org.ar/
El Insibio surgió como mutuo acuerdo de cuatro profesores de tres Facultades de la UNT: el Dr. Francisco Barbieri y el Dr. Ricardo Farías, ambos de la Facultad de Bioquímica, Química y Farmacia; el Dr. Alfredo Coviello, de Medicina y el Dr. Máximo Valentinuzzi, de Ciencias Exactas.
Se creó legalmente el 28 de noviembre de 1980, según un convenio entre la UNT y el Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (Conicet).

Página web: www.insibio.unt.edu.ar/ El Insugeo fue organizado en la Universidad Nacional de Tucumán en 1984 con el objetivo de dar respuesta a temas de investigación geológico - regional, siendo incorporado al marco de unidades ejecutoras del CONICET en el año 1996.
El equipo de trabajo está conformado por investigadores de la universidad y del CONICET. Desde su origen su temática estuvo vinculada con aquella que enfoca el Programa Internacional de Correlación Geológica que patrocina la UNESCO y la Unión Internacional de Ciencias Geológicas (IUGS).

Página web: www.unt.edu.ar/fcsnat/INSUGEO/Default.htm